More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2287 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
517 aa  1078    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.1 
 
 
552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.76 
 
 
546 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.38 
 
 
549 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.42 
 
 
547 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 
534 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
542 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.07 
 
 
550 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.67 
 
 
547 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.89 
 
 
547 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.02 
 
 
547 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.86 
 
 
549 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.54 
 
 
543 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 
518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.95 
 
 
547 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
524 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.53 
 
 
540 aa  266  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.16 
 
 
1004 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.8 
 
 
542 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  32.61 
 
 
555 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.14 
 
 
538 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.94 
 
 
538 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.55 
 
 
538 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.55 
 
 
538 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.74 
 
 
552 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.76 
 
 
538 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
552 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.6 
 
 
538 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.6 
 
 
538 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.6 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.6 
 
 
538 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
521 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
513 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.65 
 
 
539 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.47 
 
 
538 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  31.07 
 
 
552 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3399  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.46 
 
 
563 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795488  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
512 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
511 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
557 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 
524 aa  246  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
546 aa  246  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
546 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
546 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
566 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.41 
 
 
510 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 
510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.13 
 
 
546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
546 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  30.74 
 
 
548 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.64 
 
 
510 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 
510 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.91 
 
 
543 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
526 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 
525 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
499 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 
528 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1751  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
538 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.748681  normal  0.0123673 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
512 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12409  bifunctional enzyme mbtA: salicyl-AMP ligase + salicyl-S-arcp synthetase  32.8 
 
 
565 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165843  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 
576 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.09 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  31.64 
 
 
551 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  32.39 
 
 
638 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 
973 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
554 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 
510 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3471  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
549 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  30.57 
 
 
994 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
557 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3534  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
549 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  30.19 
 
 
550 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
511 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
541 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 
508 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
530 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.24 
 
 
570 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  30.77 
 
 
548 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
550 aa  230  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  31.39 
 
 
549 aa  230  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3482  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
549 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753738  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.31 
 
 
514 aa  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.23 
 
 
509 aa  230  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
509 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
541 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 
576 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
507 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>