262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3056 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 401 aa  819    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  36.01 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.75 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  34.75 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  34.5 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  34.5 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  33.67 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  34.12 
 
 		 409 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.12 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.87 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  33.43 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  33.43 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  33.61 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  36.78 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  32.76 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  31.78 
 
 		 256 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.82 
 
 		 306 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.82 
 
 		 306 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.81 
 
 		 261 aa  96.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 276 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 255 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 279 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 373 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  29.46 
 
 		 273 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 		 273 aa  86.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  27.92 
 
 		 276 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.73 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  27.38 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  32.06 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.18 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  30.81 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  30.81 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.03 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  28.83 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 271 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  27.83 
 
 		 624 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 1015 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  25.91 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  28.45 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  29.24 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  28.75 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 1001 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  28.28 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.48 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.89 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  27.04 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 		 659 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 		 660 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  25.94 
 
 		 659 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.68 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>