More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1998 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  100 
 
 		 370 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  70.68 
 
 		 368 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  56.53 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  30.38 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  36.71 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  36.71 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  30.68 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  34.88 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  32.42 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  32.96 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  32.63 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  35.86 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  33.54 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  32.95 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  33.43 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  35.45 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  34.2 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  34.32 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  32.95 
 
 		 354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  34.2 
 
 		 357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  32.52 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  29.5 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  32.62 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.6 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  31.83 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  32.04 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  31.02 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  31.25 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  32.7 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  35.57 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  32.03 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  30.4 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.96 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  28.1 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  31.08 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  33.52 
 
 		 665 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  30.51 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  30.3 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  30.23 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  32.92 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  28.75 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  34.23 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  34.41 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  34.41 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.32 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  30.59 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  31.63 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  32.87 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  26.32 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  27.93 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.85 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.46 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  30.16 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  31.07 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  31.33 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  31.25 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  32.51 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  31.64 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  31.74 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  32.1 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  31.74 
 
 		 375 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  28.96 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  26.53 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  32.06 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  27.88 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.58 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  29.57 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  31.15 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  31.87 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  28.03 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  28.03 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.34 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.34 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.34 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.34 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  30.28 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.34 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  31.58 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.99 
 
 		 367 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  29.23 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.41 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.45 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  26.99 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.39 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.45 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.45 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.45 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.85 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>