More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3470 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  95.28 
 
 		 360 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  57.22 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  50.97 
 
 		 359 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  50.97 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  47.63 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  45.28 
 
 		 359 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  35.57 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  31.03 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  29.61 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.11 
 
 		 792 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.95 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  26.2 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.9 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  27.74 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  25.99 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.03 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  26.27 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.79 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 		 1040 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  26.21 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.68 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  24.72 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.9 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  22.63 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  28.41 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  29.73 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  22.75 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  22.75 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.46 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.67 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  25.35 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.05 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  23.8 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.77 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.17 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  25.9 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.34 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  23.19 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  24.57 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  24.57 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  22.82 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  23.99 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  23.05 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.46 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  25.79 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  24.57 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  24.27 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  26.63 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  24.51 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  24.46 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  24.72 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.18 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.21 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 1096 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.53 
 
 		 395 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.87 
 
 		 400 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.48 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  23.86 
 
 		 383 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 364 aa  89.7  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  24.37 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  26.76 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  25.36 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>