214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3132 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  54.29 
 
 		 592 aa  651    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  71.6 
 
 		 596 aa  920    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  52.45 
 
 		 624 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  52.69 
 
 		 598 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  54.62 
 
 		 593 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  58.11 
 
 		 599 aa  733    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  58.45 
 
 		 595 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 598 aa  1238    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 		 606 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  59.66 
 
 		 595 aa  731    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  53.19 
 
 		 598 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  54.85 
 
 		 603 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  52.45 
 
 		 593 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  51.95 
 
 		 657 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 		 606 aa  631  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  52.03 
 
 		 640 aa  628  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 		 606 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  51.78 
 
 		 620 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  51.91 
 
 		 618 aa  618  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  51.43 
 
 		 598 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  48.57 
 
 		 597 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  49.75 
 
 		 594 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  47.74 
 
 		 597 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  47.55 
 
 		 589 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  37.29 
 
 		 593 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  36.54 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  36.27 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  35.38 
 
 		 629 aa  306  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  34.48 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  34.96 
 
 		 602 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.83 
 
 		 628 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  34.61 
 
 		 613 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.5 
 
 		 600 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.5 
 
 		 602 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.67 
 
 		 602 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  32.95 
 
 		 612 aa  296  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.71 
 
 		 602 aa  296  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  33.83 
 
 		 625 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  35.4 
 
 		 594 aa  294  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.63 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  33.99 
 
 		 609 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  33.99 
 
 		 609 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  34.16 
 
 		 609 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.77 
 
 		 611 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  35.35 
 
 		 610 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.33 
 
 		 627 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  35.12 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  34.05 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  34.78 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  34.93 
 
 		 596 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  33.44 
 
 		 609 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  34.45 
 
 		 609 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  33.06 
 
 		 610 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  35.85 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  36.05 
 
 		 665 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  33.89 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  33.82 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  36.01 
 
 		 623 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  33.56 
 
 		 619 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  34.96 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  34.28 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  33.5 
 
 		 601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.6 
 
 		 599 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  34.25 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  33.67 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  34.61 
 
 		 594 aa  282  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  35.11 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  32.48 
 
 		 612 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.44 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  32.73 
 
 		 597 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  32.43 
 
 		 596 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 601 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 600 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  32.58 
 
 		 617 aa  279  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 		 600 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 613 aa  277  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33.39 
 
 		 605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  32.51 
 
 		 645 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  33.93 
 
 		 626 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 621 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  33.61 
 
 		 645 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  34.47 
 
 		 629 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  32.41 
 
 		 612 aa  273  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 617 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  32.11 
 
 		 662 aa  273  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  34.11 
 
 		 602 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  32.26 
 
 		 624 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 620 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  32.94 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 		 621 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 593 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  32.74 
 
 		 619 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>