More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0828 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  87.05 
 
 
244 aa  397  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  84.89 
 
 
240 aa  394  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  82.59 
 
 
233 aa  384  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  79.02 
 
 
234 aa  357  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  55.8 
 
 
235 aa  247  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 
236 aa  231  8e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  49.33 
 
 
234 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  49.55 
 
 
241 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  54.05 
 
 
230 aa  224  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  49.55 
 
 
243 aa  224  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  50.46 
 
 
245 aa  224  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  52.94 
 
 
246 aa  219  2e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  49.09 
 
 
236 aa  219  2e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  48.64 
 
 
236 aa  218  9e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
237 aa  214  1e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  48.4 
 
 
236 aa  212  3e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  46.19 
 
 
234 aa  212  4e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  47.49 
 
 
236 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  46.43 
 
 
244 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  47.49 
 
 
236 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  46.82 
 
 
236 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  46.82 
 
 
236 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  46.82 
 
 
236 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  46.82 
 
 
236 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  48.17 
 
 
243 aa  207  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
220 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  46.79 
 
 
244 aa  204  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 
259 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.1 
 
 
228 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  46.36 
 
 
235 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  49.31 
 
 
235 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  48.39 
 
 
244 aa  200  1e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  44.8 
 
 
242 aa  194  8e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  45.7 
 
 
242 aa  193  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  43.24 
 
 
233 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  44.2 
 
 
232 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  44.39 
 
 
225 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  49.32 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.88 
 
 
225 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  45.81 
 
 
231 aa  189  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.88 
 
 
225 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  45.25 
 
 
246 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  189  3e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  189  3e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43.5 
 
 
237 aa  189  3e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  189  3e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
223 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
220 aa  187  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  44.8 
 
 
230 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  45.29 
 
 
242 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
223 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
229 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 
242 aa  185  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  44.59 
 
 
247 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.8 
 
 
239 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  44.14 
 
 
237 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
239 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  44.14 
 
 
237 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  43.61 
 
 
233 aa  184  1e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  43.5 
 
 
244 aa  184  1e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
238 aa  183  2e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  40.27 
 
 
223 aa  183  2e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.64 
 
 
277 aa  183  2e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.48 
 
 
235 aa  183  2e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.77551e-09 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  42.99 
 
 
256 aa  182  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 
229 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.25 
 
 
223 aa  182  4e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  43.24 
 
 
228 aa  182  4e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.4 
 
 
234 aa  182  4e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.4 
 
 
234 aa  182  4e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  43.36 
 
 
227 aa  182  5e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
233 aa  182  5e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  44.14 
 
 
250 aa  182  5e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  45.09 
 
 
224 aa  181  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  43.89 
 
 
236 aa  181  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.53 
 
 
249 aa  181  8e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
643 aa  181  9e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  42.61 
 
 
235 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  44.2 
 
 
237 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.18 
 
 
293 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.34 
 
 
230 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  48.29 
 
 
238 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  44.59 
 
 
315 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
230 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.39 
 
 
233 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
224 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  43.18 
 
 
231 aa  179  3e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
227 aa  179  3e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  2.07745e-09  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  40.99 
 
 
241 aa  179  3e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
227 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  43.24 
 
 
232 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.44 
 
 
230 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
240 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  42.22 
 
 
233 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>