85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4414 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  100 
 
 		 381 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  73.02 
 
 		 319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  53.85 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  47.57 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  47.48 
 
 		 313 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  42.09 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  29.94 
 
 		 343 aa  97.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  29.09 
 
 		 328 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.14 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  29.97 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  28.01 
 
 		 327 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  31.94 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  28.96 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  28.79 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  26.91 
 
 		 843 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  27.03 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  29.34 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  26.65 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.65 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  28.83 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  25.78 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  44.12 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  30.12 
 
 		 523 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  41.43 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  33.04 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  34.29 
 
 		 542 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  26.15 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  25.63 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  36.36 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  42.25 
 
 		 566 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  37.31 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.72 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  44.64 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.33 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  35.53 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  37.31 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  35.53 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  35.53 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  28.09 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  37.88 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  47.06 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  29.75 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  29.67 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  34.85 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  29.79 
 
 		 439 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  30.68 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  30.86 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  45.1 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30 
 
 		 474 aa  42.7  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.17 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>