More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4314 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.77 
 
 		 750 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.19 
 
 		 698 aa  728    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.04 
 
 		 671 aa  803    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.12 
 
 		 677 aa  717    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.52 
 
 		 760 aa  758    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.18 
 
 		 687 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  71.88 
 
 		 682 aa  910    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.74 
 
 		 672 aa  880    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.6 
 
 		 743 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.95 
 
 		 759 aa  655    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 		 615 aa  666    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.79 
 
 		 798 aa  769    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  56.15 
 
 		 760 aa  716    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.21 
 
 		 653 aa  690    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.99 
 
 		 682 aa  771    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  56.31 
 
 		 697 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.45 
 
 		 685 aa  857    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  100 
 
 		 753 aa  1509    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.15 
 
 		 671 aa  819    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.15 
 
 		 793 aa  735    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.13 
 
 		 696 aa  713    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.45 
 
 		 684 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.7 
 
 		 659 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57 
 
 		 602 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  61.23 
 
 		 784 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  61.06 
 
 		 783 aa  703    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.11 
 
 		 651 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  58.67 
 
 		 627 aa  680    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.96 
 
 		 679 aa  880    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.41 
 
 		 611 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.4 
 
 		 662 aa  811    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  71.92 
 
 		 656 aa  915    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.83 
 
 		 639 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.91 
 
 		 669 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.66 
 
 		 794 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  58.26 
 
 		 689 aa  730    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.08 
 
 		 672 aa  851    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  70.47 
 
 		 654 aa  922    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.65 
 
 		 801 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  61.57 
 
 		 681 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.13 
 
 		 753 aa  1108    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  61.06 
 
 		 783 aa  703    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.28 
 
 		 781 aa  718    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.53 
 
 		 620 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.64 
 
 		 684 aa  771    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.3 
 
 		 669 aa  828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.52 
 
 		 614 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.83 
 
 		 610 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.71 
 
 		 630 aa  632  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.57 
 
 		 657 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.45 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.81 
 
 		 608 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 		 621 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.48 
 
 		 610 aa  629  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 		 612 aa  631  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.51 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  54.76 
 
 		 769 aa  629  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.87 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.55 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.38 
 
 		 612 aa  628  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  55.2 
 
 		 637 aa  626  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.1 
 
 		 643 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.27 
 
 		 783 aa  624  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.13 
 
 		 643 aa  622  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.17 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  53.04 
 
 		 681 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.46 
 
 		 617 aa  620  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.13 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.64 
 
 		 652 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 		 640 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.73 
 
 		 632 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.05 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 		 637 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.71 
 
 		 651 aa  615  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.01 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.88 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  58.05 
 
 		 649 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 639 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  57.87 
 
 		 644 aa  612  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  56.35 
 
 		 645 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 		 648 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.75 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.42 
 
 		 617 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  53.27 
 
 		 764 aa  607  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  60.94 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.92 
 
 		 640 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  52.54 
 
 		 631 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.64 
 
 		 676 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.79 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.95 
 
 		 635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.1 
 
 		 604 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.99 
 
 		 642 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 		 647 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  52.91 
 
 		 633 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  52.91 
 
 		 633 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.79 
 
 		 638 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.62 
 
 		 638 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>