132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3082 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  62.16 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  48.29 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  35.77 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  37.74 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 273 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  34.63 
 
 		 283 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  35.87 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  34.75 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  37.11 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  39.9 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  34.67 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  35.68 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  36.72 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  32.58 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  29.41 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.02 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  28.38 
 
 		 741 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  35.26 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  24.58 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  32 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  30 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  31.5 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1802  aminotransferase class IV  28 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  32.87 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  25.3 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  24.69 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  25.85 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  27.02 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  25.63 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  25.93 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  26.05 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  25.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  27.74 
 
 		 588 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  24.49 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  27.14 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  26.02 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  24.37 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  25.22 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.74 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  25.63 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  28.17 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  27.54 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  25.31 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  19.05 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  27.54 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  22.69 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  25.7 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  26.03 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.14 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  26.03 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  27.46 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  25.31 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  32.59 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  28.12 
 
 		 306 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  23.63 
 
 		 347 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  26.72 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  24.48 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  28.09 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  25.63 
 
 		 285 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.75 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  28.74 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  24.75 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  18.25 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.7 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  28.74 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  24.22 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.75 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.75 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  20.72 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  23.91 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>