More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0092 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  69.49 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 231 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.83 
 
 		 2458 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.83 
 
 		 2476 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 2539 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.07 
 
 		 1992 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 226 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 231 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 227 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 2423 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  41.07 
 
 		 1987 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  43.59 
 
 		 403 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  39.83 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  40 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  42.86 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  39.83 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  39.83 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.68 
 
 		 1960 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1647 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1646 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1646 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.18 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 216 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 247 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 230 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1629 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 1609 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.03 
 
 		 2336 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 239 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  39.5 
 
 		 236 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 234 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 238 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 227 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 243 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 242 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 223 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 243 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 225 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  42.02 
 
 		 242 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 245 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1907 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 223 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  37.07 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 244 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 223 aa  93.6  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.79 
 
 		 2301 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>