More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0055 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  38.96 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  42.45 
 
 		 750 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  40.71 
 
 		 706 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  40.71 
 
 		 462 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  41.73 
 
 		 582 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  36.36 
 
 		 334 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 		 306 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.53 
 
 		 219 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  39.04 
 
 		 306 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.04 
 
 		 308 aa  104  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  38.89 
 
 		 539 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.6 
 
 		 406 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.6 
 
 		 406 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  38.13 
 
 		 706 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 331 aa  99.8  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  39.55 
 
 		 581 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.07 
 
 		 746 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 428 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 361 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.16 
 
 		 357 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 446 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 542 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.11 
 
 		 237 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  40.16 
 
 		 442 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 617 aa  90.5  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.76 
 
 		 249 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.76 
 
 		 249 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 404 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 178 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 280 aa  87.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 425 aa  87.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 		 471 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 261 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 260 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 		 343 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 371 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 1240 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.65 
 
 		 738 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 605 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 422 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.09 
 
 		 1022 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 202 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 211 aa  84.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 301 aa  84  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 		 629 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 649 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 		 1056 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 425 aa  80.9  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 1421 aa  80.9  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 292 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  33.12 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 373 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 593 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 		 804 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 547 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  34.72 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 515 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  30.83 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 		 458 aa  77.8  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 927 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 356 aa  77.4  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 308 aa  77.4  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.56 
 
 		 988 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 		 818 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1827 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 731 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 458 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 376 aa  75.5  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.13 
 
 		 839 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 543 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 367 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 784 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 295 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  33.81 
 
 		 338 aa  73.9  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 306 aa  73.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  36.08 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  32.58 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  36.27 
 
 		 929 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  33.87 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 615 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  34.75 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>