More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2384 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  69.36 
 
 		 532 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  69.36 
 
 		 532 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  68.98 
 
 		 532 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  73.09 
 
 		 474 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  74.24 
 
 		 460 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  72.5 
 
 		 533 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  69.36 
 
 		 532 aa  741    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  72.5 
 
 		 533 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  69.36 
 
 		 532 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 532 aa  1089    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  72.88 
 
 		 533 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  69.36 
 
 		 532 aa  738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  46.82 
 
 		 538 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2076  hypothetical protein  56.13 
 
 		 254 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  32.97 
 
 		 535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  31.09 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  31.09 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  31.09 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  31.09 
 
 		 518 aa  240  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  31.09 
 
 		 518 aa  240  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  31.08 
 
 		 518 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  31.27 
 
 		 518 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  31.08 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  33.6 
 
 		 506 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  34.38 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  32.44 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  30.63 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  32.69 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  31.8 
 
 		 526 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  30.99 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  30.99 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  30.99 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  30.99 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  31.08 
 
 		 518 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  31.61 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  31.05 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  34.44 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  32.1 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  31.91 
 
 		 528 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  32.23 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  29.43 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.59 
 
 		 504 aa  213  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.95 
 
 		 516 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.95 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.95 
 
 		 516 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.95 
 
 		 516 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  31.73 
 
 		 516 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  32.11 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  29.61 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  29.21 
 
 		 506 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  26.76 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  26.76 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  29.71 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  28.46 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  39.35 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  30.2 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.38 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  30.49 
 
 		 507 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  30.38 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  30.49 
 
 		 507 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  30.84 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.19 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  29.57 
 
 		 530 aa  187  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  40.29 
 
 		 519 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  28.25 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.85 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  28.77 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  28.77 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 534 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.54 
 
 		 1063 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  40.23 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  36.86 
 
 		 374 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  28.25 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  37.96 
 
 		 537 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.04 
 
 		 1120 aa  170  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  38.46 
 
 		 1346 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38 
 
 		 693 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.49 
 
 		 693 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0517  sensory box/GGDEF family protein  38.93 
 
 		 689 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0460  sensory box/GGDEF family protein  38.93 
 
 		 689 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2486  GGDEF  37.45 
 
 		 703 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  40.5 
 
 		 689 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0548  sensory box/GGDEF family protein  38.93 
 
 		 689 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0549  sensory box/GGDEF family protein  38.93 
 
 		 689 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7749100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  27.68 
 
 		 546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  31.99 
 
 		 489 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  29.54 
 
 		 588 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  28.27 
 
 		 530 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1562  diguanylate phosphodiesterase  39.34 
 
 		 326 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.34 
 
 		 693 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2757  GGDEF domain/EAL domain protein  37.85 
 
 		 703 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  40.08 
 
 		 701 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.52 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0585  sensory box/GGDEF family protein  37.55 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5086  diguanylate phosphodiesterase  27.38 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3484  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.96 
 
 		 717 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.049586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0456  sensory box/GGDEF family protein  38.52 
 
 		 689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.14 
 
 		 862 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>