49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2076 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2076  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  99.21 
 
 		 532 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  99.21 
 
 		 532 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  99.21 
 
 		 532 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  99.21 
 
 		 532 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  97.54 
 
 		 532 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  97.13 
 
 		 532 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  66.94 
 
 		 533 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  65.71 
 
 		 533 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  65.71 
 
 		 533 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  56.13 
 
 		 532 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  62.37 
 
 		 474 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  63.95 
 
 		 460 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  32.1 
 
 		 538 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  29.49 
 
 		 534 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  26.9 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  24.59 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  25.45 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  24.59 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  31.01 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  32.04 
 
 		 511 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  36.99 
 
 		 521 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 528 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  26.81 
 
 		 522 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  23.38 
 
 		 518 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  25.14 
 
 		 535 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  19.25 
 
 		 518 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  19.25 
 
 		 518 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  19.25 
 
 		 518 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  25.23 
 
 		 546 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  19.46 
 
 		 518 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  19.46 
 
 		 518 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5086  diguanylate phosphodiesterase  25.57 
 
 		 546 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  19.46 
 
 		 518 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  23.4 
 
 		 497 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  18.72 
 
 		 518 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  18.72 
 
 		 518 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  29.05 
 
 		 528 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  21.28 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  21.28 
 
 		 518 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  21.28 
 
 		 518 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  21.28 
 
 		 518 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  21.28 
 
 		 518 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5670  diguanylate phosphodiesterase  26.56 
 
 		 529 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>