More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01883 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.89 
 
 
452 aa  908  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  100 
 
 
452 aa  917  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.73191e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1683  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  99.34 
 
 
452 aa  910  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.03684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  98.67 
 
 
452 aa  907  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.46705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2747  heavy metal sensor histidine kinase  99.34 
 
 
452 aa  913  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000765675  normal  0.226821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  98.89 
 
 
452 aa  909  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  5.73761e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  99.12 
 
 
452 aa  911  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  99.12 
 
 
452 aa  912  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.60853e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  917  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.89435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  55.33 
 
 
454 aa  505  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  55.56 
 
 
454 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  55.56 
 
 
454 aa  506  1e-142  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  55.33 
 
 
454 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  55.11 
 
 
454 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
474 aa  235  1e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
469 aa  232  8e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  32.04 
 
 
467 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  34.05 
 
 
463 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  33.33 
 
 
463 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.07 
 
 
471 aa  215  1e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
481 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
480 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
465 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
480 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  34.96 
 
 
462 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  33.03 
 
 
462 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
462 aa  202  1e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
476 aa  196  8e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
466 aa  196  8e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
476 aa  196  8e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  29.93 
 
 
466 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
467 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
464 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
472 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
467 aa  190  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
485 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  29.86 
 
 
465 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
469 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
469 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
477 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
482 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
482 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  30.04 
 
 
461 aa  183  4e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.33 
 
 
463 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
469 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  26.29 
 
 
462 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
486 aa  181  3e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
489 aa  180  5e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
471 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
479 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
461 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
456 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  9.553e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
463 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33 
 
 
468 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
475 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
493 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
493 aa  174  2e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
471 aa  174  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
487 aa  174  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
471 aa  174  2e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
447 aa  174  3e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
462 aa  174  4e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
456 aa  174  4e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
467 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
455 aa  172  8e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
450 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
445 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
449 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
462 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
467 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
461 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  31.48 
 
 
486 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
465 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
465 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
477 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
481 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.93 
 
 
466 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
494 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.98 
 
 
446 aa  167  3e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  28.29 
 
 
459 aa  167  3e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  30.11 
 
 
431 aa  167  3e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
494 aa  167  3e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
477 aa  167  3e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
458 aa  167  3e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
458 aa  167  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  28.82 
 
 
463 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
450 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  29.19 
 
 
464 aa  166  6e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
458 aa  166  6e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  29.19 
 
 
464 aa  166  7e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  29.19 
 
 
464 aa  166  7e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  29.19 
 
 
464 aa  166  7e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  29.19 
 
 
464 aa  166  7e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  29.19 
 
 
464 aa  166  7e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
486 aa  165  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
465 aa  166  1e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  34.41 
 
 
463 aa  166  1e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
477 aa  165  1e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
486 aa  165  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
494 aa  165  2e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>