More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2661 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
327 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  76.52 
 
 
328 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  67.38 
 
 
328 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  46.03 
 
 
338 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  47.32 
 
 
338 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
335 aa  269  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
329 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
321 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
320 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
320 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  32.44 
 
 
352 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 
316 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
317 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  29.25 
 
 
403 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
320 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
419 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
419 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 
320 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
491 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
506 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 
393 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 
1073 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
413 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  29.43 
 
 
332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  37.14 
 
 
402 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
399 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.02 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  31.25 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  37.57 
 
 
1171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 
718 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  38.8 
 
 
427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
1237 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
345 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  38.25 
 
 
414 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  29.91 
 
 
405 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
719 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 
513 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 
649 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  31.14 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
574 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  34.52 
 
 
212 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  35.42 
 
 
563 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.18 
 
 
880 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.18 
 
 
860 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 
861 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
553 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4475  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
249 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118012  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
306 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
448 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
436 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.51 
 
 
792 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  27.7 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
550 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  36.76 
 
 
550 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
561 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
392 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 
353 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.82 
 
 
841 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 
311 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  38.82 
 
 
836 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 
346 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  39.19 
 
 
564 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
508 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
212 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
398 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
356 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
498 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 
868 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
400 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 
793 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 
619 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
414 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
448 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
444 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  31.42 
 
 
409 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  33.53 
 
 
308 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 
331 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
571 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.29 
 
 
394 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
314 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
402 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>