More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0552 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
454 aa  915    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.57 
 
 
450 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.96 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.55 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.77 
 
 
461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  37.86 
 
 
458 aa  286  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 
485 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.25 
 
 
463 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.25 
 
 
463 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.29 
 
 
465 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.29 
 
 
467 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  35.29 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  33.86 
 
 
466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.56 
 
 
464 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.82 
 
 
458 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.14 
 
 
458 aa  236  9e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.31 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.09 
 
 
443 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  34.15 
 
 
445 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.88 
 
 
474 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.45 
 
 
458 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.47 
 
 
437 aa  221  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
456 aa  212  9e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.64 
 
 
442 aa  210  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.5 
 
 
446 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.11 
 
 
473 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.12 
 
 
454 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  30.04 
 
 
445 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.61 
 
 
477 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.94 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 
483 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
455 aa  166  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.44 
 
 
460 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 
462 aa  160  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 
460 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
458 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.95 
 
 
462 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 
481 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
460 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.81 
 
 
497 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  26.85 
 
 
467 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.37 
 
 
462 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  27.49 
 
 
460 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
491 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.62 
 
 
475 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 
476 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.58 
 
 
457 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.53 
 
 
470 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 
488 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.95 
 
 
459 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1846  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 
459 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0233195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  31.96 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.16 
 
 
475 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 
478 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  26.86 
 
 
472 aa  138  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.19 
 
 
464 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.09 
 
 
462 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  26.99 
 
 
460 aa  136  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 
481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  32.79 
 
 
486 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.9 
 
 
458 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  29.17 
 
 
490 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  26.39 
 
 
474 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  31.21 
 
 
480 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.92 
 
 
473 aa  133  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  31.21 
 
 
480 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 
504 aa  133  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 
495 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.35 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.12 
 
 
495 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  33.2 
 
 
486 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  32.79 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.44 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  30.77 
 
 
473 aa  130  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.46 
 
 
473 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.05 
 
 
523 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  32.38 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.79 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.46 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  32.65 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  33.86 
 
 
493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.65 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.59 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 
547 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
465 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 
462 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  26.28 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  30.58 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  25.43 
 
 
489 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  32.43 
 
 
491 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.38 
 
 
488 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 
475 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>