266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0008 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  97.64 
 
 
259 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  60.66 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  60.24 
 
 
290 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  56.82 
 
 
309 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  53.26 
 
 
316 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  53.67 
 
 
272 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  50.77 
 
 
267 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  50.96 
 
 
268 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  49.81 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  51.3 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  50.38 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  51.32 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  50.57 
 
 
268 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  49.43 
 
 
273 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  53.08 
 
 
268 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  51.92 
 
 
265 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  49.81 
 
 
268 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  48.85 
 
 
279 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  50.77 
 
 
267 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  49.81 
 
 
264 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  52.63 
 
 
269 aa  264  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  51.82 
 
 
259 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  50.78 
 
 
267 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  48.28 
 
 
267 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  51.23 
 
 
248 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  48.45 
 
 
259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  49.61 
 
 
265 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  49.61 
 
 
268 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  50.99 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  43.98 
 
 
267 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  43.46 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  43.84 
 
 
293 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  42.86 
 
 
303 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  41.61 
 
 
318 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  41.75 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  41.2 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  42.2 
 
 
286 aa  214  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  40.35 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  41.9 
 
 
312 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  42.65 
 
 
340 aa  208  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  38.95 
 
 
305 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  42.24 
 
 
312 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  40.97 
 
 
325 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  40.77 
 
 
321 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  39.65 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  39.51 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  42.38 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  43.22 
 
 
288 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  41.61 
 
 
308 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  39.32 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  39.3 
 
 
350 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  41.2 
 
 
289 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  39.32 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  39.32 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  40.7 
 
 
303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  38.38 
 
 
313 aa  187  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  40 
 
 
296 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  39.78 
 
 
281 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  37.77 
 
 
282 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  35.29 
 
 
281 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  44.39 
 
 
270 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  41.22 
 
 
254 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  43.28 
 
 
203 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.54 
 
 
256 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  36.67 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  36.67 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  34.6 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  34.02 
 
 
243 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.44 
 
 
241 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.1 
 
 
243 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  30.42 
 
 
244 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.2 
 
 
271 aa  121  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.58 
 
 
244 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  29.92 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  34.29 
 
 
249 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  35 
 
 
244 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  39.06 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  36.14 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  30.17 
 
 
242 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  29.92 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  31.85 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.11 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  31.17 
 
 
246 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  27.76 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  31.02 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.75 
 
 
242 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  30.89 
 
 
247 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  28.11 
 
 
251 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 
240 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  30.04 
 
 
259 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 
252 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.03 
 
 
237 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  23.97 
 
 
240 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.27 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  32.37 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>