98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0026 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  100 
 
 
647 aa  1335    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  40.55 
 
 
694 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  40.46 
 
 
673 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  40.62 
 
 
673 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  40.62 
 
 
673 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  39.32 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  37.84 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  39.2 
 
 
679 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  39.62 
 
 
608 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  38.51 
 
 
612 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  34.95 
 
 
638 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  37.48 
 
 
616 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  34.71 
 
 
627 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.82 
 
 
618 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  34.72 
 
 
635 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  34.76 
 
 
635 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  36.55 
 
 
612 aa  363  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  34.35 
 
 
642 aa  362  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  37.6 
 
 
614 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  36.07 
 
 
622 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.83 
 
 
652 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  34.73 
 
 
650 aa  349  9e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  33.28 
 
 
644 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  32.62 
 
 
640 aa  342  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.92 
 
 
647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  34.86 
 
 
821 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  32.62 
 
 
640 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  33.7 
 
 
630 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  34.87 
 
 
592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  32.01 
 
 
640 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  32.01 
 
 
640 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  34.68 
 
 
592 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  34.03 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.49 
 
 
598 aa  310  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  34.65 
 
 
581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  31.74 
 
 
657 aa  303  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  34.98 
 
 
615 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  34.38 
 
 
611 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  33.33 
 
 
529 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  34.26 
 
 
605 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  31.81 
 
 
615 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  31.92 
 
 
627 aa  276  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  31.54 
 
 
570 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  30.83 
 
 
606 aa  272  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  31.65 
 
 
558 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  30.94 
 
 
610 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  34.1 
 
 
512 aa  262  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  34.33 
 
 
612 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  30.8 
 
 
535 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  31.45 
 
 
537 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  35.83 
 
 
539 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  29.91 
 
 
521 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  27.46 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  30.63 
 
 
426 aa  191  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  29.58 
 
 
424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  30.45 
 
 
427 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.13 
 
 
417 aa  180  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.42 
 
 
417 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  28.83 
 
 
416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  28.67 
 
 
410 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  27.8 
 
 
538 aa  143  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  25.56 
 
 
555 aa  139  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.75 
 
 
554 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.27 
 
 
685 aa  100  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.34 
 
 
540 aa  99.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.39 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.97 
 
 
540 aa  91.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  24.78 
 
 
514 aa  90.5  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.34 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  25.53 
 
 
541 aa  87.8  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  23.15 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  25.18 
 
 
539 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.42 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.67 
 
 
639 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  24.35 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.13 
 
 
372 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  31.68 
 
 
353 aa  47.4  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  33.33 
 
 
145 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  33.66 
 
 
101 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  32.67 
 
 
101 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.57 
 
 
353 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.87 
 
 
407 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  44.9 
 
 
98 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  27.14 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  32.67 
 
 
101 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2860  ferredoxin  41.54 
 
 
97 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3236  ferredoxin  41.54 
 
 
97 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0839485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 
580 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  44.19 
 
 
564 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.76 
 
 
354 aa  44.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.69 
 
 
353 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
558 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0698  ferredoxin  35.44 
 
 
144 aa  44.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000117119  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  43.18 
 
 
589 aa  44.3  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.17 
 
 
407 aa  44.3  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.51 
 
 
346 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.69 
 
 
575 aa  43.9  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
575 aa  43.9  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>