101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1699 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  51.45 
 
 		 197 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2718  outer membrane protein  49.36 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.700569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1376  putative outer membrane protein  49.36 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1955  outer membrane protein, putative  40.85 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.077824  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  37.61 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0345  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  36.36 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  33.19 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.8 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.63 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.64 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  33.52 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.11 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  34.72 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  30.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  32.48 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  30.94 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  33.33 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.88 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.35 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.12 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  33.63 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  30.39 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  32.85 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  31.53 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  31.53 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.29 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  32.65 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.4 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.51 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  32.34 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  31.74 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  29.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  29.52 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  31.16 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.61 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  32.61 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.61 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.09 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  29.14 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  29.49 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  30.3 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0346  hypothetical protein  28.28 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  30.29 
 
 		 452 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  32.84 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.42 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  29.19 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  29.25 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  28.22 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.36 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  30.85 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  31.11 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  27.7 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  30.81 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  27.06 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  30 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2978  outer membrane protein, putative  28.74 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0242323  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  27.07 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  31.93 
 
 		 689 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  29.52 
 
 		 662 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  33.15 
 
 		 692 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.11 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.11 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  29.34 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  28.83 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  29.65 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  26.7 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  30.5 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  28.89 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  33.74 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.45 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  27.87 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.94 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  29.03 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  28.19 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  30.05 
 
 		 241 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  24.64 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  27.33 
 
 		 997 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  33.58 
 
 		 674 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.6 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2620  OmpA domain-containing protein  32.08 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.27 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  28.85 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  31.72 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.36 
 
 		 693 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1684  OmpA domain-containing protein  33.63 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328252  normal  0.145136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.32 
 
 		 447 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  29.3 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  32 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  27.14 
 
 		 449 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  25.61 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  28.64 
 
 		 571 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  25.61 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  32.61 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.66 
 
 		 207 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  27.91 
 
 		 248 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0702  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.574194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>