More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0183 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  49.75 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  50.26 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  40.1 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  40.51 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  42.94 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  38.33 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  37.24 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  37.24 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  38.42 
 
 		 364 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  44.53 
 
 		 1287 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  35.33 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  33.73 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  33.73 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  34.54 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  32.34 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  33.01 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  34.97 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  32.49 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  28.24 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.99 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  23.56 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.18 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.9 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.38 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.03 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  27.32 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.38 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1586  hypothetical protein  38.24 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.728643  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1503  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  37.67 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.12 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  35.29 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  27.81 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  36.76 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.14 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1207  hypothetical protein  36.76 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1050  hypothetical protein  36.76 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  42.73 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0037  hypothetical protein  36.76 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0377  hypothetical protein  36.76 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.58 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1283  hypothetical protein  35.07 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  36.55 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  42.25 
 
 		 423 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 267 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.95 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>