More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1339 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 896 aa  708    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 896 aa  1828    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 		 871 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 837 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 867 aa  691    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 873 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  54.14 
 
 		 927 aa  947    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 872 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 		 869 aa  720    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 872 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 868 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.93 
 
 		 869 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.8 
 
 		 900 aa  660    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  62.9 
 
 		 872 aa  1085    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 		 865 aa  647    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 		 870 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.77 
 
 		 932 aa  710    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 870 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.86 
 
 		 872 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  60.4 
 
 		 904 aa  1084    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  60.69 
 
 		 905 aa  1041    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 		 898 aa  641    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 863 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  58.98 
 
 		 910 aa  1048    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 		 881 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 		 887 aa  670    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 872 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.77 
 
 		 858 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.95 
 
 		 872 aa  693    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 873 aa  703    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 870 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 881 aa  656    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 910 aa  664    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 910 aa  664    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 863 aa  635    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 		 891 aa  683    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.85 
 
 		 882 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 859 aa  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 860 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.01 
 
 		 857 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 		 889 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  44.12 
 
 		 868 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.85 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  36.61 
 
 		 894 aa  632  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.37 
 
 		 868 aa  635  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 853 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 880 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 858 aa  630  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 897 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 854 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 882 aa  632  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.79 
 
 		 823 aa  632  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 857 aa  631  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  37.13 
 
 		 848 aa  629  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 873 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 		 882 aa  624  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 863 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 885 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 		 858 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  40.17 
 
 		 903 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 878 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 850 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 938 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 		 878 aa  614  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 872 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 		 882 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 887 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.01 
 
 		 868 aa  610  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 840 aa  612  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 		 855 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 890 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 854 aa  608  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 		 872 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 892 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 		 888 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 856 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 888 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  39.32 
 
 		 869 aa  608  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 901 aa  606  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 895 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.57 
 
 		 875 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 892 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 		 882 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 892 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 894 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 846 aa  605  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 871 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 863 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 892 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 890 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 		 892 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 855 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.18 
 
 		 863 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 846 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 874 aa  601  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 871 aa  600  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 		 882 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 939 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 		 852 aa  601  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>