More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1589 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.22 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 425 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 346 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.9 
 
 		 263 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 254 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.68 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  29.97 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.27 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.52 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.01 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.1 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.54 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.26 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.33 
 
 		 258 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.51 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.53 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.22 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  40.34 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.72 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.44 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>