79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0048 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 352 aa  684    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  34.21 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  31.68 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  23.66 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.03 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  27.89 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.2 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  26.96 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  26.96 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.36 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  24.77 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 792 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 1040 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  26.04 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.71 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.67 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.17 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.4 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  27.18 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.51 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.2 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.3 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.41 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.68 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.62 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  24.07 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 1111 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.69 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  46.15 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.11 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.36 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.23 
 
 		 1096 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.33 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  34.94 
 
 		 1061 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  34.94 
 
 		 1061 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 364 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.49 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  43.28 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  43.28 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  18 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  41.79 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  31.06 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  35.63 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  18.9 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  18.62 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  36.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  35.44 
 
 		 478 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>