More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1918 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 812 aa  1669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  47.93 
 
 		 778 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  55.66 
 
 		 807 aa  891    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  51.12 
 
 		 807 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  53.54 
 
 		 807 aa  830    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  48.95 
 
 		 802 aa  699    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  40.08 
 
 		 804 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.59 
 
 		 795 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  39.79 
 
 		 773 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  38.59 
 
 		 843 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  38.12 
 
 		 831 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  39.24 
 
 		 831 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  38.07 
 
 		 797 aa  489  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  38.49 
 
 		 862 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  38.17 
 
 		 841 aa  482  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 		 830 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 818 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 		 818 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  37.42 
 
 		 796 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  37.41 
 
 		 835 aa  469  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  36.75 
 
 		 804 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  34.87 
 
 		 819 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  38.66 
 
 		 908 aa  459  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  37.33 
 
 		 830 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 		 819 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  36.71 
 
 		 791 aa  459  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 		 852 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  36.2 
 
 		 833 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  36.88 
 
 		 830 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  36.63 
 
 		 830 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  35.2 
 
 		 827 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  35.18 
 
 		 829 aa  452  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  35.14 
 
 		 809 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  36.05 
 
 		 804 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  35.9 
 
 		 814 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  36.32 
 
 		 832 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  33.67 
 
 		 818 aa  446  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 803 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  34.61 
 
 		 817 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  36.02 
 
 		 805 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  35.23 
 
 		 818 aa  442  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 		 810 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  34.87 
 
 		 819 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  34.68 
 
 		 808 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  34.84 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  35.89 
 
 		 833 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  35.89 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  34.72 
 
 		 823 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 852 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  35.8 
 
 		 852 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  36.06 
 
 		 852 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 817 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 		 792 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 		 791 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  35.26 
 
 		 838 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  34.26 
 
 		 845 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  33.8 
 
 		 801 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  33.42 
 
 		 797 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  33.73 
 
 		 797 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  33.93 
 
 		 804 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 		 778 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 797 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  33.25 
 
 		 797 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  33.74 
 
 		 803 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 795 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 796 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  34.06 
 
 		 771 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 		 793 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 		 796 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  33.73 
 
 		 823 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  34.89 
 
 		 791 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  33.58 
 
 		 799 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  33.25 
 
 		 797 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  33.73 
 
 		 823 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 817 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.89 
 
 		 766 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 817 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  32.55 
 
 		 794 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  32.55 
 
 		 794 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 		 815 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  34.12 
 
 		 777 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 		 799 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  32.81 
 
 		 817 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 778 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 		 838 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 817 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 814 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  34.91 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 814 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  34.91 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  34.91 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  34.74 
 
 		 797 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  34.74 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  33.25 
 
 		 854 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  34.79 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  34.57 
 
 		 790 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 777 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  33.13 
 
 		 804 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 		 786 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>