More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0429 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 764 aa  1570    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  55.35 
 
 		 242 aa  261  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  37.89 
 
 		 240 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 238 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 244 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 239 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  33.09 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 238 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 228 aa  73.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  40 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 242 aa  70.5  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 255 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  40.54 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.57 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 		 201 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 237 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 240 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2185  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  33.77 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 241 aa  62  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  42 
 
 		 197 aa  62  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  37.18 
 
 		 257 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.44 
 
 		 233 aa  60.1  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 240 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.96 
 
 		 258 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 293 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  51.92 
 
 		 279 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 1476 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 309 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 249 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 283 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.54 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  34.88 
 
 		 246 aa  59.7  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 237 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  29.34 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  52 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.44 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  35.71 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  35.94 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  36.54 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  33.68 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.52 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  25 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.64 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  32.62 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.65 
 
 		 251 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.52 
 
 		 229 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  46 
 
 		 853 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  50.98 
 
 		 276 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 245 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 273 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.99 
 
 		 251 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  48 
 
 		 243 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  43.4 
 
 		 255 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  48 
 
 		 243 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.08 
 
 		 232 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  48 
 
 		 243 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 775 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4288  hypothetical protein  33.02 
 
 		 247 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.65 
 
 		 251 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  34.62 
 
 		 309 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 281 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.1 
 
 		 239 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 277 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  52.54 
 
 		 210 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 226 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 266 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>