228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0379 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  100 
 
 
277 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  47.47 
 
 
252 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  50 
 
 
254 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  47.97 
 
 
255 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  49.18 
 
 
254 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  47.35 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  51.53 
 
 
255 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  46.91 
 
 
259 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  46.89 
 
 
257 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  48.84 
 
 
246 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  44.35 
 
 
258 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  45.37 
 
 
248 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  46.25 
 
 
246 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  46.08 
 
 
257 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  48.84 
 
 
248 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  45.38 
 
 
250 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  47.11 
 
 
246 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  45.08 
 
 
244 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  45.19 
 
 
253 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  45.19 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  42.46 
 
 
259 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  42.46 
 
 
259 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  44.35 
 
 
258 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  43.16 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  44.34 
 
 
234 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41 
 
 
244 aa  170  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  41.3 
 
 
262 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  41.3 
 
 
262 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  40.43 
 
 
262 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  42.67 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  42.36 
 
 
248 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  40.31 
 
 
260 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  40.77 
 
 
235 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  38.59 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  37.05 
 
 
261 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
256 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  27.51 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  26.42 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
272 aa  62.4  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  26.38 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  27.62 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  27.57 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  24.14 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  27.07 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  30.17 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  26.05 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  26.69 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.58 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  30.72 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  30.04 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
219 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  26.27 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  31.43 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
239 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.07 
 
 
230 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34 
 
 
276 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 
237 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  30.39 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  28.08 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  21.67 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  23.39 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  26.38 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
810 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>