188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0484 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 318 aa  653    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  35.21 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  33.53 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  32.72 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  29.97 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 		 272 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 271 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  24.84 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  25.91 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  25.77 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  31.74 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  32.56 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  26.89 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  32.03 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.41 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.17 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  26.96 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  22.95 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  27.48 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  22.86 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  25.77 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  30.5 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  25.31 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  34.74 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  29.75 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  36.96 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  30.33 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.82 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  27.93 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.97 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  27.27 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  35.35 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  23.36 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  24.42 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.1 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  31.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  31.3 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  29.06 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.86 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  27.83 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  29.82 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.89 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.3 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  27.62 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  33.33 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  31.43 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  27.68 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  25.41 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  25.69 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  30.77 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  26.96 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 487 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.97 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  27.62 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  27.08 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  28.37 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.66 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  28.68 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  25.71 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  22.54 
 
 		 249 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  27.13 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>