More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2007 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  64.38 
 
 		 541 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  62.86 
 
 		 544 aa  651    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  65.71 
 
 		 544 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  64.05 
 
 		 545 aa  661    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  63.58 
 
 		 539 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.02 
 
 		 545 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  63.28 
 
 		 542 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  67.75 
 
 		 540 aa  689    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  69.67 
 
 		 544 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  69.87 
 
 		 544 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  69.87 
 
 		 544 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 546 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 541 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.77 
 
 		 537 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 576 aa  645    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  62.14 
 
 		 547 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 548 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 542 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 540 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  65.52 
 
 		 542 aa  663    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 544 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 560 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 554 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 547 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 551 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  63.25 
 
 		 538 aa  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.98 
 
 		 547 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  63.96 
 
 		 542 aa  674    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  65.2 
 
 		 546 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 548 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  69.67 
 
 		 544 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 536 aa  660    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  63.36 
 
 		 555 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 544 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.91 
 
 		 552 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  63.25 
 
 		 538 aa  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  66.91 
 
 		 539 aa  718    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  69.23 
 
 		 536 aa  727    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 548 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 547 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  63.41 
 
 		 541 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  64.49 
 
 		 540 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  64.14 
 
 		 547 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  65.33 
 
 		 547 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  65.46 
 
 		 540 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 544 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 549 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  64.18 
 
 		 549 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  78.53 
 
 		 542 aa  820    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  62.79 
 
 		 550 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 543 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 546 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0616  chaperonin GroEL  62.14 
 
 		 547 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0352411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.66 
 
 		 553 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  63.65 
 
 		 545 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 547 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  64.93 
 
 		 539 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 540 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  64.38 
 
 		 541 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.39 
 
 		 540 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  62.95 
 
 		 544 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 542 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 542 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 539 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 539 aa  709    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 561 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 542 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 546 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  68.97 
 
 		 546 aa  732    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  62.4 
 
 		 551 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.38 
 
 		 538 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  63.89 
 
 		 545 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  64.02 
 
 		 542 aa  673    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 541 aa  652    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  64.14 
 
 		 543 aa  669    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 539 aa  672    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  66.99 
 
 		 539 aa  671    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  63.12 
 
 		 545 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 549 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  65.28 
 
 		 543 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 542 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  65.74 
 
 		 539 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  69.01 
 
 		 542 aa  707    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.31 
 
 		 554 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 542 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 545 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 545 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  63.15 
 
 		 541 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  64.43 
 
 		 541 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  64.38 
 
 		 541 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  64.75 
 
 		 541 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  64.84 
 
 		 547 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  64.58 
 
 		 538 aa  654    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  62.6 
 
 		 544 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3675  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 548 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  61.3 
 
 		 544 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  60.48 
 
 		 543 aa  638    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  72.81 
 
 		 541 aa  746    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 547 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 542 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>