More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0330 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  303  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  68.35 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  67.63 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  66.18 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  63.12 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  64.29 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  62.77 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 145 aa  184  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  58.99 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 149 aa  169  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 145 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000697609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  57.78 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  57.04 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  50.69 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0721  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  52.17 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  50.74 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  53.24 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  50.74 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4678  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.44664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0505  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  54.68 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.09 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_447  ribosomal protein L13  51.45 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000466788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0971  ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  8.8963e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>