More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0505 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0505  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 143 aa  299  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_447  ribosomal protein L13  98.6 
 
 		 143 aa  296  7e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000466788  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0482  50S ribosomal protein L13  96.5 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 147 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  54.35 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  53.33 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 143 aa  159  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  51.47 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.07 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  48.92 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  52.52 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  50.37 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  49.63 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  53.33 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  48.2 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  54.74 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 142 aa  153  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  50.37 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  48.92 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  48.55 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  48.2 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  51.09 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  48.92 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  48.92 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>