79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5127 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 932 aa  1934    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 1421 aa  194  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2565  ankyrin  27.52 
 
 		 973 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00388007  normal  0.0998723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51910  Ankyrin  26.32 
 
 		 954 aa  108  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  22.73 
 
 		 1047 aa  98.6  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  23.71 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  25.11 
 
 		 734 aa  70.5  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  24.63 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  22.15 
 
 		 662 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 564 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0727  exsB protein  23.45 
 
 		 1310 aa  61.2  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.202441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 		 695 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  21.28 
 
 		 1107 aa  57  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.83 
 
 		 696 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2853  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  23.84 
 
 		 673 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 758 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.07 
 
 		 833 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  22.94 
 
 		 722 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  23.28 
 
 		 699 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.26 
 
 		 757 aa  52.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 724 aa  51.6  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 760 aa  51.2  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  22.35 
 
 		 656 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.33 
 
 		 858 aa  50.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 807 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 716 aa  50.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.15 
 
 		 710 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 666 aa  49.7  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 726 aa  49.3  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 		 690 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 728 aa  48.9  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  21.29 
 
 		 708 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  22.98 
 
 		 1127 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 1244 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  23.23 
 
 		 1135 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 743 aa  48.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.62 
 
 		 722 aa  47.8  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  22.96 
 
 		 695 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.73 
 
 		 658 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.37 
 
 		 669 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.67 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  29.81 
 
 		 852 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.18 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.1 
 
 		 669 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 816 aa  47  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  24.67 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.59 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 		 737 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 		 697 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 759 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  21.34 
 
 		 648 aa  46.2  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  22.87 
 
 		 687 aa  46.2  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  19.37 
 
 		 1238 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  21.34 
 
 		 648 aa  46.2  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  25.08 
 
 		 819 aa  46.2  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.32 
 
 		 813 aa  46.2  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.77 
 
 		 773 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 1290 aa  45.8  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  22.98 
 
 		 738 aa  45.4  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  20.16 
 
 		 657 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.78 
 
 		 706 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 712 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  22.46 
 
 		 658 aa  45.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  23.94 
 
 		 696 aa  45.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.29 
 
 		 662 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 		 662 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.29 
 
 		 768 aa  45.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.47 
 
 		 682 aa  45.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  20.8 
 
 		 815 aa  45.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  21.47 
 
 		 759 aa  44.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.88 
 
 		 797 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 		 706 aa  44.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.25 
 
 		 669 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 735 aa  44.3  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.25 
 
 		 669 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>