252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3078 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  100 
 
 		 2313 aa  4451    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0736  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.15 
 
 		 1305 aa  988    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.4308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  49.46 
 
 		 688 aa  343  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  57.2 
 
 		 447 aa  269  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.74 
 
 		 631 aa  221  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  43.84 
 
 		 857 aa  182  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  39.22 
 
 		 631 aa  160  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0735  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.5 
 
 		 268 aa  152  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000183583  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  59.67 
 
 		 848 aa  129  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  44.25 
 
 		 625 aa  115  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.1 
 
 		 830 aa  103  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 710 aa  103  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 		 1321 aa  102  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  43.11 
 
 		 1000 aa  102  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.41 
 
 		 1821 aa  99.4  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.76 
 
 		 693 aa  97.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  35.09 
 
 		 1208 aa  97.1  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  37.58 
 
 		 932 aa  96.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  35.4 
 
 		 573 aa  96.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  34.78 
 
 		 1710 aa  92.8  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 685 aa  93.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  31.48 
 
 		 926 aa  92.8  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  33.96 
 
 		 1081 aa  92.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 223 aa  91.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.32 
 
 		 4630 aa  91.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.31 
 
 		 1328 aa  90.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  40 
 
 		 758 aa  90.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  30.64 
 
 		 920 aa  89.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  28.72 
 
 		 506 aa  89.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  33.17 
 
 		 820 aa  89  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  32.62 
 
 		 518 aa  88.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  34.81 
 
 		 625 aa  88.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.1 
 
 		 1009 aa  87  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  44.68 
 
 		 935 aa  87  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.82 
 
 		 1226 aa  87  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  36.75 
 
 		 629 aa  86.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  33.54 
 
 		 914 aa  85.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  33.92 
 
 		 542 aa  84.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.09 
 
 		 1847 aa  84  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  35.4 
 
 		 530 aa  84  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  28.7 
 
 		 693 aa  84  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.15 
 
 		 3027 aa  84.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.37 
 
 		 526 aa  84  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1756 aa  84.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  31.1 
 
 		 288 aa  83.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  34.59 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  38.98 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 939 aa  82.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  31.87 
 
 		 531 aa  82.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 1174 aa  82  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  37.91 
 
 		 605 aa  82  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  32 
 
 		 1260 aa  82  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  34.32 
 
 		 767 aa  81.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1194 aa  81.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  36.36 
 
 		 548 aa  80.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  43.01 
 
 		 1204 aa  80.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  32.48 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.94 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.64 
 
 		 692 aa  79.7  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  36.59 
 
 		 746 aa  79.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 		 1029 aa  79  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  35.22 
 
 		 396 aa  77.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  30.88 
 
 		 807 aa  77.4  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.37 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  28.82 
 
 		 935 aa  76.3  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.41 
 
 		 1661 aa  75.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.54 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.54 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.54 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  33.54 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.54 
 
 		 410 aa  75.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  31.58 
 
 		 223 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  31.58 
 
 		 223 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  42 
 
 		 1977 aa  74.7  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  30.11 
 
 		 863 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  31.58 
 
 		 223 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.48 
 
 		 1234 aa  74.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 410 aa  74.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 530 aa  74.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  31.02 
 
 		 531 aa  73.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 471 aa  74.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  30.5 
 
 		 1168 aa  73.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  30.12 
 
 		 1154 aa  73.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.69 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  32.73 
 
 		 921 aa  73.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  33.15 
 
 		 822 aa  72.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  37.59 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  30.58 
 
 		 282 aa  72.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.55 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.05 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  30.4 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.95 
 
 		 995 aa  72  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  34.75 
 
 		 669 aa  72.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  30.83 
 
 		 624 aa  72  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  30 
 
 		 1184 aa  72  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  30.3 
 
 		 538 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.11 
 
 		 575 aa  71.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 520 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1026  S-layer protein  30.59 
 
 		 223 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00354744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>