More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2739 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  100 
 
 		 428 aa  843    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  61.83 
 
 		 428 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  51.87 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  53.04 
 
 		 438 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  50.23 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  48.36 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  48.83 
 
 		 426 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  50.7 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  47.79 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  48.71 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  46.35 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  46.95 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  46.48 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  43.02 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  47.9 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  51.78 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  51.23 
 
 		 428 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  44.64 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  44.84 
 
 		 446 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  41.92 
 
 		 433 aa  349  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  42.42 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  42.42 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  43.24 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  40.71 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  37.53 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  40.74 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  41.59 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  41.56 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  36.75 
 
 		 439 aa  275  9e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  38.57 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  38.6 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  37.88 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  38.28 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  35.88 
 
 		 427 aa  259  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  36.3 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  37 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  39.23 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  36.87 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.02 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.73 
 
 		 488 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.7 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  35.02 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  34.15 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.01 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.88 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  35.78 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  33.58 
 
 		 461 aa  223  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  31.65 
 
 		 483 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  33.88 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.78 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  32.72 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  33.41 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.18 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  33.17 
 
 		 429 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  33.17 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  31.31 
 
 		 481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.26 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  31.25 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29.07 
 
 		 460 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.84 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  31.41 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.5 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  30.34 
 
 		 455 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  30.34 
 
 		 455 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.81 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  30.28 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  34.17 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.67 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  31.8 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  30.33 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.33 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  32.05 
 
 		 500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  28.31 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  30.63 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  30.61 
 
 		 471 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  30.36 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  30.36 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  30.36 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  33.17 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  29.6 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  28.21 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  32.01 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.36 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  28.96 
 
 		 474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  29.22 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  31.03 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.77 
 
 		 437 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  30.75 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.86 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  28.99 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  30.05 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.24 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>