123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1628 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  80.95 
 
 		 397 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 400 aa  815    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  79.95 
 
 		 397 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  72.25 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  58.9 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  56.46 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  37.86 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  33.76 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  34.61 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  36.73 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  35.63 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  33.17 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  34.88 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  34.89 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  34.89 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  34.02 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  33.33 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  36.15 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  31.26 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  31.95 
 
 		 407 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  32.27 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.85 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  31.96 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  33.01 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  31.95 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  32.27 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  35.8 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  31.57 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  31.39 
 
 		 417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  31.63 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  34.22 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  31.95 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  32.19 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  32.33 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  31.14 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  31.39 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  34.77 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  34.77 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  34.16 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  34.46 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  33.22 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  30.33 
 
 		 440 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.99 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  33.68 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  35.56 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  33.22 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  32.39 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  34.34 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  32.7 
 
 		 450 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  32.67 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  31.07 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  33.68 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  34.87 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  30.27 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  32.01 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  33.99 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  33 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  32.85 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  29.85 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.77 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  32.88 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  32.88 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.73 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  33.22 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  32.34 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  32.89 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.46 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  31.4 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  32.38 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  28.5 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  30.18 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.08 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  29.86 
 
 		 427 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  29.86 
 
 		 427 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  29.86 
 
 		 427 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  32.77 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  29.27 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  29.94 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.81 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  28.05 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  28.05 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  25.48 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.52 
 
 		 479 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.65 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  24.77 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  26.6 
 
 		 562 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25.09 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  26.07 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  24.87 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  26.02 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  26.02 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  26.02 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  26.67 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  25.75 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  26.17 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  25.55 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  25.55 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.69 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.69 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>