232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1202 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  773    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  25.21 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.28 
 
 		 365 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.93 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24.93 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  22.77 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1718  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 394 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 402 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  21.17 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  21.17 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1776  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.56574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  22.52 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.84 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.22 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  22.38 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.27 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  20 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.29 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.27 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.27 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.27 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.27 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.38 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  20.37 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.14 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.14 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  23.14 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  21.28 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.14 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.14 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  23.14 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  23.14 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.14 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  19.88 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  20.8 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.98 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  20 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  21.87 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  22.86 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  20.68 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.89 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.76 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  21.1 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.58 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  25.38 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.36 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.44 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>