224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2171 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  100 
 
 
493 aa  961    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  55.65 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  52.25 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  54.83 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  51.39 
 
 
484 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  52.25 
 
 
484 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  51.61 
 
 
484 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  51.82 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  54.11 
 
 
483 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  51.82 
 
 
484 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  53.8 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  52.03 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  54.01 
 
 
484 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  54.41 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  53.1 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  49.9 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  53.68 
 
 
484 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  53.62 
 
 
484 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  51.8 
 
 
472 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  50.31 
 
 
481 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  49.9 
 
 
481 aa  448  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  48.64 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  52.93 
 
 
481 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  48.32 
 
 
480 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  48.12 
 
 
480 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 
480 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  49.28 
 
 
490 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  47.91 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  46.75 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  47.91 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  47.61 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  48.12 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  47.91 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  47.91 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  47.89 
 
 
480 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  46.33 
 
 
480 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  47.17 
 
 
480 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  45.51 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  46.38 
 
 
481 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  44.05 
 
 
482 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  46.54 
 
 
480 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  46.38 
 
 
485 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  46.04 
 
 
498 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  42.2 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  40.04 
 
 
482 aa  336  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  42.18 
 
 
466 aa  335  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  42.65 
 
 
510 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  44.88 
 
 
498 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  39.3 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  38.12 
 
 
466 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  38.63 
 
 
466 aa  322  8e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  40.21 
 
 
482 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  40.21 
 
 
482 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  43.89 
 
 
484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  41.37 
 
 
484 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  37.6 
 
 
483 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.3 
 
 
488 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  38.68 
 
 
483 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  41.16 
 
 
484 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.7 
 
 
491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.81 
 
 
485 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.12 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.33 
 
 
483 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  40.21 
 
 
484 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.64 
 
 
484 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  36.02 
 
 
482 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  35.19 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.11 
 
 
488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.46 
 
 
485 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  36.19 
 
 
466 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.6 
 
 
483 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.33 
 
 
485 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  39.21 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  38.85 
 
 
488 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  40.05 
 
 
494 aa  269  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.63 
 
 
485 aa  269  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  38.85 
 
 
488 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.95 
 
 
485 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.94 
 
 
481 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.98 
 
 
485 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  33.61 
 
 
487 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.33 
 
 
478 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.08 
 
 
483 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  37.4 
 
 
485 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  37.42 
 
 
485 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 
482 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.78 
 
 
484 aa  262  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.21 
 
 
485 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.21 
 
 
485 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.31 
 
 
498 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  37 
 
 
485 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 
485 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 
485 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 
485 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.57 
 
 
485 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.38 
 
 
486 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  37.01 
 
 
482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  37.11 
 
 
482 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.65 
 
 
485 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>