More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6918 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 376 aa  791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.41 
 
 		 376 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.62 
 
 		 376 aa  552  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1985  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.15 
 
 		 376 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.09 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.02 
 
 		 376 aa  541  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  66.49 
 
 		 376 aa  542  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.09 
 
 		 376 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.7 
 
 		 377 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 		 376 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0026  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 		 374 aa  489  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.49 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.32 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1512  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.42 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1591  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00100827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.67 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.25 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 		 367 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.73 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.71 
 
 		 388 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.85 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.2 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.12 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0175  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.45 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 472 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 380 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.8 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.57 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.43 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.34 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.87 
 
 		 387 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.47 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.35 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.24 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.49 
 
 		 385 aa  359  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.9 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 		 376 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.65 
 
 		 383 aa  358  7e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.8 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.97 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.64 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.26 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>