More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2996 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  100 
 
 		 746 aa  1536    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.61 
 
 		 760 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 740 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.09 
 
 		 740 aa  267  5.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.61 
 
 		 728 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  38.78 
 
 		 751 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  39.72 
 
 		 727 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  39.3 
 
 		 728 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  37.95 
 
 		 728 aa  204  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  36.6 
 
 		 733 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  42.55 
 
 		 728 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.71 
 
 		 741 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  40.28 
 
 		 728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  37.81 
 
 		 720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  32.64 
 
 		 745 aa  193  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  26.59 
 
 		 735 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  32.21 
 
 		 813 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  35.76 
 
 		 753 aa  184  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  34.54 
 
 		 739 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  36.1 
 
 		 667 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  35.1 
 
 		 736 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  27.84 
 
 		 748 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  31.01 
 
 		 804 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.01 
 
 		 803 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  25.8 
 
 		 735 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  34.54 
 
 		 738 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.68 
 
 		 751 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  33.88 
 
 		 738 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  33.88 
 
 		 738 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.75 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  34.11 
 
 		 754 aa  178  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.75 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  34.36 
 
 		 737 aa  177  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  33.04 
 
 		 737 aa  177  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.97 
 
 		 738 aa  177  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  35.23 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  30.25 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  30.81 
 
 		 920 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  30.81 
 
 		 930 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  30.81 
 
 		 945 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  30.81 
 
 		 933 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  31.01 
 
 		 852 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  29.92 
 
 		 796 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  33.9 
 
 		 790 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.53 
 
 		 767 aa  171  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  25.12 
 
 		 777 aa  170  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  33.22 
 
 		 738 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  33.22 
 
 		 738 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  33.22 
 
 		 738 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  33.22 
 
 		 737 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.72 
 
 		 798 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  30.05 
 
 		 714 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  30.98 
 
 		 776 aa  164  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  27.31 
 
 		 750 aa  164  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  26.88 
 
 		 733 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  30.05 
 
 		 771 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  27.63 
 
 		 764 aa  151  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  32.22 
 
 		 707 aa  147  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  27.03 
 
 		 775 aa  147  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  30.85 
 
 		 745 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.36 
 
 		 293 aa  143  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  31.97 
 
 		 950 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  27.27 
 
 		 875 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  29.8 
 
 		 981 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  30.79 
 
 		 894 aa  141  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  30.48 
 
 		 900 aa  140  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  38.1 
 
 		 323 aa  140  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.94 
 
 		 320 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  27.89 
 
 		 729 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  30.67 
 
 		 923 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  30.52 
 
 		 909 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.91 
 
 		 273 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.4 
 
 		 256 aa  137  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  37.62 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34 
 
 		 311 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  34.35 
 
 		 308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.27 
 
 		 263 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.61 
 
 		 263 aa  132  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.71 
 
 		 260 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.27 
 
 		 263 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.27 
 
 		 263 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.27 
 
 		 263 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.27 
 
 		 263 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.24 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  34.45 
 
 		 275 aa  130  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.24 
 
 		 347 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  29.93 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  29.93 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.4 
 
 		 302 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.93 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.28 
 
 		 349 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.45 
 
 		 275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.24 
 
 		 347 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.2 
 
 		 306 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.51 
 
 		 308 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.24 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.61 
 
 		 358 aa  129  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.25 
 
 		 263 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  31.54 
 
 		 317 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  31.06 
 
 		 302 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>