More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0376 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  100 
 
 		 428 aa  848    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  48.36 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  50.23 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  48.24 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  45.24 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  47 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  48.71 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  48.59 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  47.07 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  46.48 
 
 		 425 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  46.48 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  46.24 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  46.01 
 
 		 425 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  43.99 
 
 		 436 aa  346  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  42.72 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  42.89 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  44.07 
 
 		 433 aa  338  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  44.07 
 
 		 433 aa  338  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  41.31 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  44.96 
 
 		 446 aa  335  9e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  42.65 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  41.36 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  44.76 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  47.12 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  46.58 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  41.59 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  41.16 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  41.96 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  41.25 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  36.38 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  39.86 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  41.59 
 
 		 427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  39.15 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  38 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  38.26 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  37.18 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.79 
 
 		 488 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.11 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.5 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  35.03 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  36.64 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.58 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  36.57 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.57 
 
 		 439 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.7 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  34.41 
 
 		 478 aa  209  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  31.78 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.68 
 
 		 463 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  32.09 
 
 		 500 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.08 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  33.84 
 
 		 428 aa  199  5e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.25 
 
 		 483 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  31.08 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29.86 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  32.32 
 
 		 481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  29.98 
 
 		 466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  30.61 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  32.4 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  30.07 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  30.07 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  31.74 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.59 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  30.23 
 
 		 481 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.41 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  30.23 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  30.23 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  30.07 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  31.09 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  30 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  31.03 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.11 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  29.48 
 
 		 507 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  30.75 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.49 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  29.49 
 
 		 513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  31.13 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.4 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.66 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.66 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30.48 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.22 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.57 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  29.47 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  30.75 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  31.4 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  31.66 
 
 		 434 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  31.37 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.13 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.13 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.13 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.13 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  31.22 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  30.96 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  29.79 
 
 		 471 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>