More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0429 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  81.27 
 
 		 412 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  815    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  84.35 
 
 		 417 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  78.93 
 
 		 413 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  71.43 
 
 		 412 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  70.44 
 
 		 418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  70.8 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  71.05 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  60.88 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  55.72 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  60.34 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  55.75 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  55.77 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  59.9 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  59.64 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  59.38 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  56.86 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  52.26 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  52.7 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  50.74 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  54.17 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 436 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 382 aa  87.4  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.38 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  29.12 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  29.12 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.8 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.8 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  26.37 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  29.12 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.8 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.8 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.8 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.41 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.03 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  31.06 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.44 
 
 		 477 aa  72.8  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  26.36 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  27.8 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  28.43 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  27.35 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  27.35 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>