More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0534 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  71.81 
 
 		 450 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 447 aa  934    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  56.4 
 
 		 461 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  55.34 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  51.23 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  50.67 
 
 		 457 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  51.37 
 
 		 450 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  52.48 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  49.66 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  47.56 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  42.95 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  45.01 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  44.84 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  45.72 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  43.26 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  30.61 
 
 		 484 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.1 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.84 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 492 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 485 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 453 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 486 aa  136  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 440 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 351 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 728 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 510 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.51 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 565 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  26.46 
 
 		 275 aa  87.4  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.28 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 402 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  23.64 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.99 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  20.65 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.23 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>