More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0361 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0361  histidine kinase  100 
 
 		 468 aa  939    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000148321  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0007  multi-sensor signal transduction histidine kinase, putative  32.26 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 718 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  26.61 
 
 		 621 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 339 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 		 547 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  26.87 
 
 		 674 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 631 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  31.31 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 722 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  30.84 
 
 		 465 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 516 aa  93.2  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  30.84 
 
 		 465 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  30.37 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  29.44 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2781  histidine kinase  34.25 
 
 		 321 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  30.37 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 520 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 486 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  29.44 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  32.74 
 
 		 667 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 641 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.63 
 
 		 541 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  37.61 
 
 		 746 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 639 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 523 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  43.12 
 
 		 581 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 514 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  26.52 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  28.97 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  28.97 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 611 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 642 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  24.88 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 673 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  24.31 
 
 		 661 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  28.97 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  25.81 
 
 		 673 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 613 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  30.59 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 991 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 991 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 646 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  38.79 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 661 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 987 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  24.05 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  31.86 
 
 		 646 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 589 aa  87.4  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 923 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  32.54 
 
 		 542 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  28.3 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  29.44 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.11 
 
 		 516 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0565  histidine kinase  25.46 
 
 		 237 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 991 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  22.48 
 
 		 553 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  27.83 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0568  histidine kinase  25.46 
 
 		 237 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 682 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  26.29 
 
 		 612 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 936 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.5 
 
 		 365 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 985 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2671  sporulation kinase B  36 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0225198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.19 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1697  histidine kinase  25.49 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  27.36 
 
 		 617 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0536  histidine kinase  25.23 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.204687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  27.07 
 
 		 983 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.03 
 
 		 933 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 991 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2387  sporulation kinase B  35.06 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  26.94 
 
 		 982 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2712  sporulation kinase B  36.05 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2426  sporulation kinase B  36.05 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  25.95 
 
 		 599 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.27 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 		 766 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 662 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 602 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 		 770 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  26.64 
 
 		 983 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  34.62 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>