289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4722 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 154 aa  309  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  45.91 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  44.87 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  45.51 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  48.12 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  44.1 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  44.72 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  41.67 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  41.04 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  41.56 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  44.38 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  38.31 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  39.38 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  34.76 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  36.36 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  51.14 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  34.97 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  48.91 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  32.73 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  32.12 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  29.63 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  32.12 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  32.73 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  31.52 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  31.52 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  32.73 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  33.94 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  33.94 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  30.99 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  30.99 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  31.52 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.76 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.54 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  28.48 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  29.7 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  39.49 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  29.82 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  35.85 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  42.5 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  27.88 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.14 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  43.59 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  35.76 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  40.32 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  35.71 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  34.42 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  42.5 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  32.91 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.52 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  30.3 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  38.31 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  30.3 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  35.19 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  40.85 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  34.42 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  32.52 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>