289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3345 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  44.59 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  44.3 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  41.77 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  41.46 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  41.14 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  40.62 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  39.62 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  39.02 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  40.25 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  38.75 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  39.62 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  40.51 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  38.22 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 155 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 155 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  34.39 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  39.88 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  41.4 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  40.51 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  37.74 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3822  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>