More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1714 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  44.49 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  43.98 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.2 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  45.62 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  41.05 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.29 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.32 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.61 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  40.09 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.86 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.04 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  39.21 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  41.28 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  41.28 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  41.52 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  41.63 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.04 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  38.16 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  40.62 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  43.06 
 
 		 385 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.57 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.3 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.71 
 
 		 377 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.22 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.35 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.98 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.13 
 
 		 383 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.04 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.35 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.13 
 
 		 383 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.39 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.91 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  41.44 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  41.51 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  40.35 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  44.33 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  42.33 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  40.61 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  38.36 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.73 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  38.74 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  41.3 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  40.93 
 
 		 282 aa  151  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  37 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  37.89 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.12 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.12 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.73 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.16 
 
 		 259 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  36.73 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.34 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  40.54 
 
 		 229 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.91 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  40.44 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  40.35 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.16 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  40.54 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  36.28 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  40.35 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  38.03 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.94 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  35.53 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  40.27 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  40.69 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  35.84 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  34.78 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.29 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  40 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  39.56 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.43 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  37.23 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  34.82 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  40.54 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.72 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  40.54 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  37.22 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  39.64 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.51 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.04 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.19 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  36 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.15 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  37.95 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  37.1 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  41.15 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  39.01 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  38.36 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  38.96 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  40.27 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.12 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>