293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0434 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
392 aa  776  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  58.52 
 
 
398 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  58.73 
 
 
394 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  51.28 
 
 
385 aa  338  1e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  45.53 
 
 
386 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  34.78 
 
 
374 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  1e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  1e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  1e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.57 
 
 
372 aa  244  2e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  2e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  2e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  36.43 
 
 
373 aa  244  2e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  2e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  36.18 
 
 
375 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.84 
 
 
386 aa  243  4e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  35.04 
 
 
369 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.15 
 
 
360 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  34.69 
 
 
370 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  34.69 
 
 
370 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.18 
 
 
373 aa  229  7e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  37.4 
 
 
374 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  37.97 
 
 
371 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.96 
 
 
375 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  34.61 
 
 
371 aa  222  1e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32.32 
 
 
374 aa  220  4e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  34.1 
 
 
374 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  35.55 
 
 
371 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  34.27 
 
 
369 aa  214  3e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.86 
 
 
365 aa  213  6e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  31.89 
 
 
361 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  31.89 
 
 
361 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.85 
 
 
376 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.57 
 
 
372 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  36.36 
 
 
390 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  33.81 
 
 
359 aa  202  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.56 
 
 
381 aa  201  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.41 
 
 
371 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  31.89 
 
 
366 aa  198  2e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  37.4 
 
 
376 aa  197  4e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.3 
 
 
397 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  32.32 
 
 
364 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.15 
 
 
390 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.73 
 
 
358 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  34.5 
 
 
384 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  35.89 
 
 
402 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.36 
 
 
364 aa  190  3e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.35 
 
 
364 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.48 
 
 
365 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.69 
 
 
399 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  34.64 
 
 
390 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.53 
 
 
377 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.59 
 
 
398 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  36.53 
 
 
404 aa  186  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  36.67 
 
 
380 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  36.41 
 
 
380 aa  185  1e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  36.41 
 
 
380 aa  185  1e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  36.44 
 
 
387 aa  185  1e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  38.32 
 
 
377 aa  185  1e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.95 
 
 
378 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.44 
 
 
379 aa  183  4e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  32.57 
 
 
365 aa  183  4e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  33.69 
 
 
352 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  34.67 
 
 
401 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.98 
 
 
380 aa  179  6e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  38.34 
 
 
390 aa  179  6e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  37.03 
 
 
371 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  34.02 
 
 
420 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  32.39 
 
 
368 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.05 
 
 
363 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  35.03 
 
 
414 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.38 
 
 
370 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.47 
 
 
377 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  37 
 
 
377 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.31 
 
 
391 aa  175  1e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  36.36 
 
 
380 aa  175  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  36.36 
 
 
380 aa  175  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  35.32 
 
 
386 aa  175  1e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.85 
 
 
360 aa  175  1e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.52 
 
 
362 aa  174  2e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  38.79 
 
 
387 aa  174  3e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  35.34 
 
 
399 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  37.97 
 
 
376 aa  172  8e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  29.12 
 
 
362 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  34.52 
 
 
389 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.09 
 
 
397 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  35.19 
 
 
371 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  32.4 
 
 
348 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  32.4 
 
 
348 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  34.83 
 
 
370 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  33.33 
 
 
364 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.71 
 
 
374 aa  167  3e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  35.81 
 
 
385 aa  167  3e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.88 
 
 
420 aa  167  3e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.59 
 
 
370 aa  166  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
382 aa  165  2e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  36.69 
 
 
357 aa  164  2e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>