More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0052 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0052  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  763    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0533756  normal  0.852382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2877  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2611  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.4 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  22.16 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  22.47 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2170  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.31 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  24.77 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  24.77 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  24.66 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  23.63 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  21.96 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  23.65 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  23.65 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  32.35 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  23.68 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 607 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3885  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  21.33 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3260  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435908  normal  0.03191 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  22.39 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  23.31 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  23.31 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1609  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 503 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5202  putative inner membrane transport protein  26.8 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  0.154518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.29 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1904  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  29.63 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.5 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  23.49 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  20.43 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 529 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.75 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.08 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 408 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  22.91 
 
 		 471 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.4 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 464 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  22.99 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4773  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4392  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4479  major facilitator superfamily transporter  29.03 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  25.48 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  26.13 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  34.29 
 
 		 475 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.94 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  24.92 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  25.58 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.49 
 
 		 635 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.07 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1261  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.34 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0278283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00489  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13830)  26.35 
 
 		 552 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  29.49 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  26.81 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  30.57 
 
 		 467 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 474 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  21.64 
 
 		 473 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01240  arabinose efflux permease family protein  25.75 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>