More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9047 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 437 aa  886    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  71.43 
 
 		 439 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  69.34 
 
 		 446 aa  631  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  68.28 
 
 		 438 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  65.81 
 
 		 441 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  69.32 
 
 		 446 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  65.57 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  64.8 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  64.95 
 
 		 438 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  62.61 
 
 		 436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  60.23 
 
 		 440 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  60.18 
 
 		 437 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  61.02 
 
 		 611 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  60.28 
 
 		 440 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  63.48 
 
 		 416 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  61.77 
 
 		 454 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  57.35 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  49.01 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  49.63 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  44.25 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  43.6 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 		 400 aa  328  8e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 399 aa  312  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.49 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 		 411 aa  302  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.78 
 
 		 399 aa  302  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.65 
 
 		 417 aa  299  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 413 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 393 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.09 
 
 		 406 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.93 
 
 		 393 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.44 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.44 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.02 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.05 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.68 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.3 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.91 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 		 394 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 405 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.3 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.3 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.3 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.3 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.3 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.3 
 
 		 393 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 397 aa  282  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.61 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 411 aa  278  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 406 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 397 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 377 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 411 aa  272  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 401 aa  272  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.63 
 
 		 406 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 340 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.13 
 
 		 420 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  35.7 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 397 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>