More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2778 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  49.02 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  48.82 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.47 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  48.82 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  47.24 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  48.24 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  46.85 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  48.24 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  48.24 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  47.24 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  48.82 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  47.33 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  40.23 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  39.38 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.97 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  42 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38.11 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  37.25 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  40.24 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.92 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>