268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1489 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  322  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  45.52 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  45.14 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  47.22 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  44.3 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  43.75 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  46.26 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  42.07 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  40.69 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  40.97 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  42 
 
 		 150 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  36.55 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  42.07 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  38.19 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  41.38 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  39.44 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  37.06 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  39.01 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  30.5 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  32.31 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  40.23 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  31.21 
 
 		 258 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  28.99 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  31.82 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  27.4 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  27.34 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  27.34 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  30.22 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  27.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.57 
 
 		 1372 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  31.06 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  28.99 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.06 
 
 		 1345 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  27.34 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  28.67 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  27.74 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  27.48 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  32 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  28.05 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  25.38 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  27.05 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  28.89 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  28.37 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  32 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  33.05 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  36.89 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  27.14 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  34.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  25.55 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  22.41 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  27.01 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  28.91 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  25.55 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25.93 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  24.82 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  27.69 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  27.34 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.12 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  28.06 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.34 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  27.62 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  25.35 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  27.01 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  27.34 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  37.17 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  28.77 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  27.61 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25.4 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  25.53 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  25.9 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  31.36 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  26.24 
 
 		 236 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  30.34 
 
 		 315 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  21.18 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  28.36 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  26.32 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  34.78 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  26.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  27.54 
 
 		 253 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  25.17 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  26.71 
 
 		 251 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  29.13 
 
 		 326 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  24.09 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25.93 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  28.03 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  35.87 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  23.19 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>